Из 10 членов Фонда свт. Николая, 7 человек входят в состав Совета Директоров (СД), который осуществляет непосредственное управление фондом. Приведем список членов фонда по состоянию на 1 января 2020г. с указанием должностей.
Митрополит Корсунский и Западноевропейский Антоний (Севрюк) – Президент СД
Пьяных Юрий Дмитриевич – Вице-президент, член СД
Валко Петрос – Вице-президент, член СД
Лапушкин Олег Иванович – член СД
Гусев Валерий Иванович – член СД
Климов Глеб Алексеевич – член СД
Панков Вадим Николаевич – член СД
Протоиерей Павел Поваляев
Тринько Вячеслав Геннадьевич – глава комитета по строительному надзору
Закхеос Сотос
Черницын Сергей Юрьевич
Также за деятельностью Фонда свт. Николая установлен надзор со стороны РПЦ в лице Ильичева Михаила Владимировича, старшего юриста Управления Московской Патриархии по Зарубежным Учреждениям. Он осуществляет юридический и финансовый контроль деятельности Совета Директоров.
Правоустанавливающими документами, на основании которых Фонд свт. Николая ведет свою деятельность, являются Устав и Учредительный договор.